En total 79 distintos directores técnicos han dirigido al cuadro azulcrema, 41 mexicanos, 34 extranjeros (18 argentinos, cuatro españoles, tres uruguayos, dos brasileños, dos chilenos, un croata, un húngaro, un neerlandés, un peruano, un paraguayo, un británico y un yugoslavo) y dos cuyas nacionalidades se desconocen. De los 19 técnicos que lograron al menos un título con la institución, tres de ellos ya se habían coronado también como jugadores: Récord Garza, Octavio Vial y Carlos Reinoso.
Para el Apertura 2002 Cuauhtémoc Blanco regresa al equipo buscando obtener el bicampeonato, en este mismo torneo las Águilas hicieron su presentación hasta la jornada 2 contra Guadalajara, ya que su primer partido sería contra Pachuca, pero debido a su compromiso con la Libertadores se aplazó la fecha; en ese mismo torneo Manuel Lapuente se separó provisionalmente del cargo, regresando hasta la fecha 11, por problemas de salud; en el interinato de Mario Carrillo el equipo logró una buena productividad de 8 victorias y dos empates, con el regreso de Lapuente el equipo terminó en primer lugar de la tabla, producto de 13 victorias, 4 empatados y 2 perdidos (43 puntos, camiseta mexico 2022 récord de torneos cortos).
